La microfauna o microorganismos son organismos que habitan en el suelo y tienen un tamaño inferior a 0,2 mm. Los organismos, que son más grandes, pertenecen a la mesofauna. Microorganismos, pequeños nematodos y rotíferos (animales de ruedas) pertenecen a la microfauna. En su mayoría viven de forma saprofita o como depredadores de bacterias en los poros del suelo. La mayoría de los animales de la microfauna pueden formar quistes en condiciones de vida desfavorables y, por lo tanto, sobrevivir durante varios años.
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