Las moléculas son partículas diatómicas o poliatómicas, que se mantienen unidas por enlaces químicos y son lo suficientemente estables, por ejemplo, para poder ser observadas espectroscópicamente. Pueden ser partículas neutras, pero también radicales, iones o aductos iónicos. Por ejemplo, muchos tipos de moléculas interestelares no son estables en condiciones terrestres. La IUPAC llama a estas partículas entidades moleculares.